في 17 يونيو 1999 مقررالمؤتمر التأسيسي للأتحاد إنشاء هذه المنظمة بأسم " إتحاد مجلس الدول الأعضاء في منظمة المؤتمر الاسلامي " و مقرها في طهران عاصمة الجمهورية الاسلامية الايرانية . و في 24 أبريل 2001 متم رسميا إفتتاح مقر الاتحاد علي يد سماحة الشيخ مهدي كروبي ، رئيس مجلس الشوري الاسلامي الايراني وقتئذٍ بصفته رئيس المؤتمر التاسيسي، و بحضور عدد كبير من رؤساء المجالس الأعضاء و البرلمانيين و رؤساء البعثات الدبلوماسية المعتمدين في طهران .
و لاتحول عضوية الأتحاد دون العضوية في أي مجموعة برلمانية أقليمية أو دولية أخري. ويمكن للمنظمات الأقليمية أو الدوليه حضور مؤتمرات الأتحاد بصفة المراقب و ذلك بتوصية من لجنته التنفيذيه وموافقه المؤتمر. و يحق للمراقبين التعبير عن وجهات نظرهم ولكن بدون الادلاء بأصواتهم .
و يبلغ عدد أعضاء الأتحاد حاليا خمسين مجلساً عضوا .
إن صفة المراقب لدي الاتحاد مفتوحة بطلب أي من مجالس منظمة المؤتمر الاسلامي و كذلك من المنظمات الأقليمية والدولية التي تبدي رغبتها في تقديم أسهاماتعملية قيمة لصالح عمل الأتحاد. و يجوز لمؤتمر الاتحاد منح صفة المراقب أو تعليقها أو أنهائها بمقتضي أحكام لائحة الاجراءات الخاصه بذلك . و يوجد في الوقت الراهن عشر منظمات تتمتع بصفة المراقب لدي الأتحاد.
كان أول أمين عام للأتحاد هو سعادة السيد ابراهيم أحمد عوف و هو دبلوماسي مصري تم إنتخابه بواسطة دورة استثنائيه عقدها المجلس بمدينه طهران . و قد تولي مقاليد منصبه هذا لفترتين متتاليتين و ذلك من اليوم الأول من شهر مارس عام 2000 م و حتي اليوم الثلاثين من شهر أبريل 2008 م .
و في الدورة الاستثنائيه الثانية للمجلس التي عقدت بمدينه اسطنبول التركية في 24 مارس 2008 م تم إنتخاب سعادة البروفسور محمود ايرول قليج ، من تركيا ، أمينا عاما جديدا للأتحاد و قد تولي سعادته مسؤولية منصبه في اليوم الأول من شهر مايو 2008 م . و كان سعادة السفير محمد بيروي قد تولي منصب أول امين عام مساعد للأتحاد . و باشر مهامه لفترتين متتاليتين من شهر مارس 2001 م وحتي 31 مارس 2008 م . كما تم في الدورة الاستثنائيه الثانية للأتحاد التي عقدت باسطنبول في 24 مارس 2008 م إنتخاب سعادة السفير علي أصغر محمدي سيجاني أمينا عاما مساعدا للأتحاد . و تولى مهام منصبه إعتبارا من أول أبريل 2008 م .
