تمثل الأمانة العامة الجهاز الخامس من أجهزة الاتحاد ، ومقرها طهران . وتقوم الأمانة العامة بالمهام التالية:
Ø تيسير الاتصالات المستمرة فيما بين أعضاء الاتحاد ، وبين الاتحاد والبرلمانات ، وبينه وبين غيره من الهيئات والمنظمات الإقليمية والدولية الأخرى.
Ø تولي الشئون المالية والإدارية للاتحاد
Ø إعداد المواضيع التي يدرسها المؤتمر والمجلس وكذلك إعداد الوثائق والتقارير والمضابط والمراسلات اللازمة.
Ø العناية بمحفوظات الاتحاد.
Ø إبلاغ أعضاء الاتحاد وسائر الهيئات المعنية بما يتخذه المؤتمر والمجلس من قرارات ومقرارات وتوصيات.
Ø اتخاذ التدابير اللازمة لكفالة تنفيذ مايقرره الاتحاد.
يرأس الأمين العام أمانة الاتحاد .
يقوم المجلس بانتخاب الأمين العام بترشيح من أعضاء الاتحاد . ويتولى مهام منصبه لفترة مقدارها أربعة أعوام ، قابلة للتجديد مرة واحدة.
مع مراعاة التوزيع الجغرافي العادل يقترح الأمين العام على المجلس تعيين الأمناء العاميين المساعدين والمديرين وكبار المسئولين الآخريين .
وتتكون الأمانة العامة حالياً من الأفراد الآتية أسماؤهم :-
Ø السيد / أطهر حسين زيدي – رئيس الإدارة المالية ،
Ø السيد / إبراهيم أحمد ضرار – كبير المترجمين،
Ø السيد / أسامة محمود عبد الفتاح – مساعد رئيس الشئون المالية ،
Ø السيد / حقي اويغور- مدير الشؤون الإدارية وبروتوكول
،
Ø السيدة/ سهيلة صبري – سكرتيرة الأمين العام ،
Ø السيدة / تاميلا كريم بور – مساعدة في قسم تقنية المعلومات ،
Ø السيدة / شرارة فتحي زادة – مساعدة في إدارة المؤتمرات ،
Ø السيد / رضا نظري - سكرتيرة الأمانة العامة
